Годината е 2054. Петдесет години след бедствието. Петдесет години, след като лицето на Земята е станало пусто. След като се оттеглят в летящото убежище на Лапута, оцелелите от човешката раса поддържат съществуването си. Точно тогава едно въстание срещу нарастващата твърдост и корумпираност на човешкото лидерство на Лапута прераства в конфликт, който унищожава колонията. Сега, последните оцелели са в немилост отново. Ще успеят ли да си възвърнат позициите на Земята, отнети им от незнайните сили, които са ги прогонили в небесата?